ClickCease
+ 1-915-850-0900 spinedoctors@gmail.com
Vælg side

Epigenetik

Tilbage Klinik Epigenetik Functional Medicine Team. Studiet af arvelige ændringer i genekspression (aktive versus inaktive gener) involverer ikke ændringer i DNA-sekvensen, en ændring i fænotype uden en ændring i genotype, som påvirker hvordan celler læser gener. En epigenetisk ændring er en regelmæssig, naturlig begivenhed, der også kan påvirkes af flere faktorer: alder, miljø, livsstil og sygdomstilstand. Epigenetiske modifikationer kan almindeligvis vise sig som, hvordan celler terminalt differentierer sig til hudceller, leverceller, hjerneceller osv. Og epigenetiske ændringer kan have mere skadelige virkninger, der kan resultere i sygdomme.

Ny og igangværende forskning afdækker løbende epigenetiks rolle i en række menneskelige lidelser og dødelige sygdomme. Epigenetiske mærker er mere stabile i voksenalderen. De menes dog stadig at være dynamiske og kan ændres af livsstilsvalg og miljøpåvirkning. Det er ved at blive tydeligt, at epigenetiske virkninger ikke kun opstår i livmoderen, men i løbet af hele menneskets liv. En anden opdagelse er, at epigenetiske ændringer kan vendes. Talrige eksempler på epigenetik viser, hvordan forskellige livsstilsvalg og miljøeksponeringer kan ændre mærker på DNA og spille en rolle i at bestemme sundhedsresultater.


Genetisk-epigenetisk ernæring og vores sundhed | El Paso, TX.

Genetisk-epigenetisk ernæring og vores sundhed | El Paso, TX.

Hvordan bidrager epigenetisk og personlig ernæring til optimal sundhed?

De fleste af os ved om usund mad, hvordan det påvirker vores krop. De

  • Sænk metabolisme
  • Tilføj vægt
  • Tilstopper og hærder arterier mv.
epigenetisk ernæring sundhed el paso tx.

Men nu er der fødevarer og madelementer, som kan hjælpe os på en måde og kommer fra et sted, vi måske ikke havde tænkt på, og det er vores DNA.

Nutriepigenomics undersøger sammenhænge mellem kost og biomarkører, der kan vedhæftes eller fjernes fra vores DNA. Dette slår vores gener til eller fra.

Det viser nye undersøgelser helt sikkert fødevarer eller kosttilskud kan justere udtrykket af vores gener, hvilket kan påvirke vores helbred.

Ernæringsgenomik revolutionerer både klinisk og folkesundhedsernæringspraksis:

Kost, motion og miljøeksponering er alle elementer, der har vist en rolle i at tænde og slukke for gener gennem epigenetik. Justering af livsstilsfaktorer kan kontrollere potentialet for at reducere sygdom og have en positiv indvirkning på vores helbred.

Sundhedspersonale fra hele verden begynder at inkorporere epigenetik i deres praksis med det formål at levere mere specialiserede og individualiserede behandlingsplaner.

specialist i rygsmerter

�Lag information såsom kost, livsstil, miljøfaktorer, familiehistorie, symptomer og diagnoser sammen med epigenetik kan hjælpe med at guide nogen til en tilstand af optimeret sundhed, sagde Kristy Hall, MS, RNCP, ROHP, en bestyrelsescertificeret funktionel ernæringsekspert og grundlægger af Living Well Nutrition, der bruger epigenetisk testning, ernæringsrådgivning og en mangefacetteret tilgang til bedre at forsørge sine kunder.


Maj 15, 2018Bailey Kirkpatrick KostSygdomme og lidelserMiljøNyheder og anmeldelser
ernæringsstrategier

Registrerede diætister har mulighed for at komme med genetisk drevne kostanbefalinger, der kan forbedre menneskers sundhed.

Ernæring er en af ​​de primære miljøfaktorer, der bestemmer vores helbred. Kroniske sygdomme omfatter:

  • Type 2 diabetes
  • Metabolisk syndrom
  • Hjerte-kar-sygdom
  • Neurologisk sygdom
  • Forskellige kræftformer
  • Startes eller accelereres af næringsstof/føde

Dette felt af ernæringsforskning kan omtales som Nutritional Genomics.

Enkeltnukleotidpolymorfier (SNP'er) er enkelt basepar forskelle i DNA. De repræsenterer en primær form for menneskelig genetisk variation.

DNA SNP

Det øvre DNA-molekyle adskiller sig fra det nedre DNA-molekyle på en enkelt basepar-placering (en C/A-polymorfi)

Ernæringsgenetik eller nutrigenetik involverer identifikation, klassificering og karakterisering af menneskelig genetisk variation, der ændrer næringsstofmetabolisme/-udnyttelse og fødevaretolerancer Fig1.

epigenetisk ernæring sundhed el paso tx.
IOM. Nutrigenomics og videre: Informere fremtiden. Washington, DC: The National Academies Press; 2007.

Anvendelse: Genetisk & Epigenetik

Næringsstoffer, f.eks. lægemidler, er kraftfulde effektorer af genomekspression og stabilitet, og disse gen-næringsstof-interaktioner kan optimeres til sygdomsforebyggelse.

epigenetisk ernæring sundhed el paso tx.

Individualiseret ernæring

Løftet om ernæringsteknologi for optimal sundhed gennem kosten er stadig i gang, men offentligheden har positive forventninger, som det fremgår af brugen af ​​kosttilskud.

Videnskabelig forskning viser, at næringsstoffer i forskellige fødevarer og kosttilskud, vi spiser, kan være i stand til at justere eller vende arvelige ændringer. Disse beviser kan bruges til at træffe bedre livsstilsvalg.

Blåbær er utroligt høj i antioxidanter, og det menes, at denne "superfood" epigenetisk kan reducere DNA-skader og derved beskytte mennesker mod kræft og muligvis endda langsom aldring. Blåbærjuice og C-vitamin har vist sig at være potentielle methyleringshæmmere for MTHFR-genet og DNMT1-genet hos mennesker.


Kim, M., Na, H., Kasai, H., Kawai, K., Li, Y.-S., & Yang, M. (2017). Sammenligning af blåbær (Vaccinium spp.) og C-vitamin via antioxidative og epigenetiske effekter hos mennesker. Journal of Cancer Prevention, 22(3), 174-181.

At lære om, hvad vi spiser, og hvad det gør ved vores krop, især potentiel epigenetisk påvirkning, er kun et skridt tættere på optimal sundhed.

Epigenetikernes rolle i fedme og metabolisk sygdom

Epigenetikernes rolle i fedme og metabolisk sygdom

Epigenetisk Abstrakt:

Den øgede forekomst af fedme og relaterede comorbiditeter er et stort folkesundhedsproblem. Mens genetiske faktorer utvivlsomt spiller en rolle ved bestemmelsen af ​​individuel modtagelighed for vægtøgning og fedme, forklarer de identificerede genetiske varianter kun en del af variationen. Dette har ført til øget interesse for at forstå den potentielle rolle epigenetik som en middelmotor for gen-miljøinteraktioner, der ligger til grund for udviklingen af ​​fedme og dets associerede comorbiditeter. Indledende beviser til støtte for en epigenetisk rolle i fedme og type 2 diabetes mellitus (T2DM) blev primært tilvejebragt af dyreforsøg, som rapporterede epigenetiske ændringer i vigtige metabolisk vigtige væv efter fedmfodring og epigenetiske forskelle mellem magre og overvægtige dyr og ved menneskelige studier, der viste epigenetiske ændringer i fedme og T2DM kandidatgener hos overvægtige / diabetiske individer. For nylig har fremskridt i epigenetiske metoder og de reducerede omkostninger ved epigenom-omfattende associeringsundersøgelser (EWAS) ført til en hurtig ekspansion af undersøgelser i humane populationer. Disse undersøgelser har også rapporteret epigenetiske forskelle mellem obese / T2DM voksne og sunde kontroller og epigenetiske ændringer i forbindelse med ernærings-, vægttab og træningsinterventioner. Der er også øget beviser fra både mennesker og dyr, at forholdet mellem perinatale ernæringsmæssige eksponeringer og senere risiko for fedme og T2DM kan medieres af epigenetiske ændringer i afkom. Formålet med denne gennemgang er at sammenfatte den seneste udvikling på dette hurtigt bevægelige område med særlig fokus på human EWAS og undersøgelser, der undersøger virkningen af ​​nærings- og livsstilsfaktorer (både præ- og postnatal) på epigenomet og deres forhold til metaboliske sundhedsmæssige resultater. Vanskelighederne ved at skelne konsekvensen af ​​årsagssammenhæng i disse undersøgelser og dyremodellernes kritiske rolle for at teste årsagssammenhænge og give indsigt i underliggende mekanismer er også behandlet. Sammenfattende har området med epigenetik og metabolisk sundhed haft en hurtig udvikling på kort tid. Mens resultaterne hidtil er lovende, er der igangværende undersøgelser, og det næste årti lover at være en tid for produktiv forskning i de komplekse interaktioner mellem genomet, epigenomet og miljøet, da de vedrører metabolisk sygdom.

nøgleord: Epigenetika, DNA-methylering, Fedme, Type 2 diabetes, Udviklingsprogrammering

Introduktion

Epigenetiske mekanismerFedme er en kompleks, multifaktorial sygdom, og bedre forståelse af mekanismerne bag interaktionerne mellem livsstil, miljø og genetik er afgørende for at udvikle effektive strategier til forebyggelse og behandling [1].

I et samfund, hvor energitæt mad er rigeligt, og behovet for fysisk aktivitet er lavt, er der stor variation i individers modtagelighed for at udvikle fedme og metaboliske sundhedsproblemer. Estimater af arvelighedens rolle i denne variation ligger i intervallet 40-70 %, og mens store genom-wide association-studier (GWAS) har identificeret en række genetiske loci forbundet med fedmerisiko, er de ~100 mest almindelige genetiske varianter kun tegner sig for nogle få procent af variansen i fedme [2, 3]. Genom-dækkende estimater er højere og tegner sig for ~20 % af variationen [3]; dog forbliver en stor del af arveligheden uforklarlig.

For nylig har opmærksomheden vendt sig mod at undersøge rollen af ​​epigenetiske ændringer i ætiologien af ​​fedme. Det er blevet hævdet, at epigenomet kan repræsentere den mekanistiske forbindelse mellem genetiske varianter og miljøfaktorer ved bestemmelse af fedmerisiko og kunne hjælpe med at forklare den manglende arvelighed. De første humane epigenetiske undersøgelser var små og undersøgte kun et begrænset antal loci. Selvom dette generelt resulterede i dårlig reproducerbarhed, var nogle af disse tidlige fund, for eksempel forholdet mellem PGC1A-methylering og type 2 diabetes mellitus (T2DM) [4] og andre som diskuteret i van Dijk et al. [5], er blevet gentaget i senere undersøgelser. Nylige fremskridt og øget overkommelighed for high-throughput-teknologier giver nu mulighed for storskala epigenom wide association studies (EWAS) og integration af forskellige lag af genomisk information for at udforske de komplekse interaktioner mellem genotypen, epigenomet, transkriptomet og miljøet [6� 9]. Disse undersøgelser er stadig i deres vorden, men resultaterne indtil videre har vist lovende at hjælpe med at forklare variationen i fedmemodtagelighed.

Der er stigende bevis for, at fedme har udviklet mental oprindelse, da eksponering for en suboptimal næringsstofforsyning før fødslen eller i den tidlige barndom er forbundet med en øget risiko for fedme og metabolisk sygdom senere i livet [10 13]. Oprindeligt viste dyreforsøg, at en række ernæringsmæssige eksponeringer i tidligt liv, især dem, der blev oplevet tidligt i svangerskabet, kunne inducere epigenetiske ændringer i afkomets vigtigste metaboliske væv, der vedvarede efter fødslen og resultere i permanente ændringer i genfunktionen [13 17] Der er bevis for at støtte eksistensen af ​​den samme mekanisme hos mennesker. Dette har ført til en søgning efter epigenetiske mærker til stede tidligt i livet, der forudsiger senere risiko for metabolisk sygdom, og undersøgelser for at afgøre, om epigenetisk programmering af metabolisk sygdom kunne forhindres eller vendes senere i livet.

Denne anmeldelse giver en opdatering af vores tidligere systematiske gennemgang af undersøgelser om epigenetik og fedme hos mennesker [5]. Vores tidligere gennemgang viste de lovende resultater af indledende studier, herunder de første potentielle epigenetiske mærker for fedme, der kunne påvises ved fødslen (f.eks. RXRA) [18]. Det fremhævede dog også den begrænsede reproducerbarhed af resultaterne og manglen på større skalaundersøgelser. Den nuværende gennemgang fokuserer på den seneste udvikling på dette hurtigt bevægelige område og især på human EWAS og undersøgelser, der undersøger virkningen af ​​nærings- og livsstilsfaktorer på epigenet og epigenetikkens fremtrædende rolle i fedmepatologien . Vi løser også vanskelighederne med at identificere årsagssammenhæng i disse undersøgelser og dyremodellernes betydning for at give indsigt i mekanismer.

anmeldelse

Epigenetiske ændringer i dyremodeller af fedme

kanin spiserDyremodeller giver unikke muligheder for stærkt kontrollerede undersøgelser, der giver mekanistisk indsigt i rollen af ​​specifikke epigenetiske mærker, både som indikatorer for den aktuelle metaboliske status og som forudsigere for den fremtidige risiko for fedme og metabolisk sygdom. Et særligt vigtigt aspekt af dyreforsøg er, at de giver mulighed for vurdering af epigenetiske ændringer i målvæv, herunder leveren og hypothalamus, hvilket er meget vanskeligere hos mennesker. Desuden gør evnen til at høste store mængder frisk væv det muligt at vurdere flere kromatinmærker samt DNA-methylering. Nogle af disse epigenetiske modifikationer, enten alene eller i kombination, kan reagere på miljøprogrammering. I dyremodeller er det også muligt at studere flere generationer af afkom og dermed muliggøre differentiering mellem trans-generationel og intergenerationel overførsel af fedmerisiko medieret af epigenetisk hukommelse om forældrenes ernæringsstatus, som ikke let kan skelnes i menneskelige undersøgelser. Vi bruger førstnævnte betegnelse for meiotisk overførsel af risiko i fravær af fortsat eksponering, mens sidstnævnte primært indebærer direkte overførsel af risiko gennem metabolisk omprogrammering af fosteret eller kønscellerne.

Dyreforsøg har spillet en kritisk rolle i vores nuværende forståelse af epigenetikens rolle i fedmens og T2DM's udviklingsmæssige oprindelse. Både øget og nedsat maternær ernæring under graviditet har været forbundet med øget fedtaflejring hos afkom fra de fleste pattedyrarter, der er undersøgt til dato (gennemgået i [11, 13 15, 19]). Maternær ernæring under graviditet har ikke kun potentiale for direkte virkninger på fosteret, det kan også direkte påvirke de udviklende oocytter hos kvindelige fostre og primære kimceller hos mandlige fostre og kan derfor påvirke både efteråret og bedstefødt. Derfor er multigenerationelle data normalt nødvendige for at skelne mellem moderens intergenerationelle og transgenerationelle transmissionsmekanismer.

Tabel 1 opsummerer en række dyremodeller, der er blevet anvendt til at fremlægge bevis for metaboliske og epigenetiske ændringer i afkom i forbindelse med ernæringens modersmål. Den indeholder også oplysninger om undersøgelser, der identificerer ændrede epigenetiske mærker hos voksne individer, der gennemgår direkte ernæringsmæssige udfordringer. Tabellen er struktureret af den foreslåede risikotransmissionstype.

tabel 1(i) Epigenetiske ændringer i afkom associeret med modernæring under svangerskabet

Maternel ernæringstilskud, underernæring og overernæring under graviditeten kan ændre fedtaflejring og energihomeostase hos afkom [11, 13-15, 19]. Forbundet med disse effekter hos afkommet er ændringer i DNA-methylering, histon post-translationelle modifikationer og genekspression for flere målgener, især gener, der regulerer fedtsyremetabolisme og insulinsignalering [16, 17, 20-30]. Mangfoldigheden af ​​dyremodeller brugt i disse undersøgelser og de almindelige påvirkede metaboliske veje tyder på en evolutionært bevaret adaptiv respons medieret af epigenetisk modifikation. Imidlertid er få af de specifikke identificerede gener og epigenetiske ændringer blevet krydsvalideret i relaterede undersøgelser, og storstilede genom-dækkende undersøgelser er typisk ikke blevet anvendt. En væsentlig hindring for sammenligning af disse undersøgelser er de forskellige udviklende mentale vinduer, der er udsat for ernæringsmæssige udfordringer, som kan forårsage betydeligt forskellige resultater. Der kræves også bevis for, at de epigenetiske ændringer er kausale snarere end at være forbundet med afkoms fænotypiske ændringer. Dette vil nødvendiggøre identifikation af et ernæringsmæssigt induceret epigenetisk hukommelsesrespons, der går forud for udviklingen af ​​den ændrede fænotype hos afkom.

(ii) Virkninger af fædre ernæring på afkom Epigenetiske tegn

baby sovende holde hænderNye undersøgelser har vist, at faderens ernæringsplan kan påvirke afkomfedtaflejring og epigenetiske mærker [31 34]. En nylig undersøgelse ved hjælp af mus har vist, at faderlig præ-diabetes fører til øget modtagelighed for diabetes hos F1-afkom med tilhørende ændringer i bugspytkirtelgenekspression og DNA-methylering forbundet med insulinsignalering [35]. Vigtigere var, at der var en overlapning af disse epigenetiske ændringer i bugspytkirteløer og sæd, hvilket antyder kimliniearv. Imidlertid er de fleste af disse undersøgelser, selvom de er spændende i deres implikationer, begrænsede i den genomiske undersøgelsesskala og viser ofte svage og noget forbigående epigenetiske ændringer forbundet med milde metaboliske fænotyper hos afkom.

(iii) Potentielle transgenerationsmæssige epigenetiske ændringer, der fremmer fedtaflejring i afkom

overskydende ernæringStabil transmission af epigenetiske oplysninger på tværs af flere generationer er vel beskrevet i plante systemer og C. elegans, men dens betydning hos pattedyr er stadig meget omdiskuteret [36, 37]. Et epigenetisk grundlag for bedsteforældreoverførsel af fænotyper som reaktion på diæteksponering er blevet veletableret, herunder i husdyrarter [31]. De mest indflydelsesrige undersøgelser, der viser effekter af epigenetisk transmission, der påvirker afkoms fænotype, har brugt eksemplet med den levedygtige gule agouti (Avy) mus [38]. I denne mus forårsager en insertion af en retrotransposon opstrøms for agouti-genet dets konstitutive ekspression og deraf følgende gule pelsfarve og fedme fra voksne. Maternel transmission gennem kimlinjen resulterer i DNA-methyleringsmedieret dæmpning af agouti-ekspression, hvilket resulterer i vildtype pelsfarve og mager fænotype af afkommet [39, 40]. Det er vigtigt, at efterfølgende undersøgelser i disse mus viste, at moderens eksponering for methyldonorer forårsager et skift i pelsfarve [41]. En undersøgelse har rapporteret overførsel af en fænotype til F3-generationen og ændringer i ekspression af et stort antal gener som respons på proteinrestriktion i F0 [42]; Ændringer i ekspression var imidlertid meget varierende, og en direkte forbindelse til epigenetiske ændringer blev ikke identificeret i dette system.

(iv) Direkte eksponering af personer til overdreven ernæring i postnatalt liv

moderne vestlige livsstilSelvom mange undersøgelser har identificeret diætassocierede epigenetiske ændringer i dyremodeller ved anvendelse af kandidatsitespecifikke regioner, er der blevet gennemført få genomgående analyser. En nylig undersøgelse fokuserede på at bestemme den direkte epigenetiske virkning af fedtholdige diæt / diætinduceret fedme hos voksne mus ved anvendelse af genomgående genekspression og DNA-methyleringsanalyser [43]. Denne undersøgelse identificerede 232 differentielt methylerede regioner (DMR'er) i adipocytter fra kontrol og fedmede fedmus. Vigtigt er de tilsvarende humane regioner for de murine DMR'er også differentielt methyleret i fedtvæv fra en population af overvægtige og magre mennesker og derved fremhæver den bemærkelsesværdige evolutionære bevarelse af disse regioner. Dette resultat understreger den sandsynlige betydning af de identificerede DMR i regulering af homeostase i pattedyr.

Human Studies

anatomi 3D model

På baggrund af beviser fra dyreforsøg og med den stigende tilgængelighed af overkommelige værktøjer til genomfødt analyse har der været en hurtig ekspansion af epigenomstudier hos mennesker. Disse undersøgelser har for det meste fokuseret på identifikation af stedspecifikke forskelle i DNA-methylering, der er forbundet med metaboliske fænotyper.

Et centralt spørgsmål er, hvorvidt epigenetiske modifikationer bidrager til udviklingen af ​​den metaboliske fænotype, snarere end blot at være en følge heraf (Fig. 1). Epigenetisk programmering kan bidrage til fedmeudvikling samt spille en rolle med den deraf følgende risiko for kardiovaskulære og metaboliske problemer. I menneskelige studier er det svært at bevise årsagssammenhæng [44], men der kan udledes en række beviser:

Fig 1(i) Genetiske associeringsundersøgelser. Genetiske polymorfier, der er forbundet med en øget risiko for at udvikle særlige tilstande, er a priori knyttet til de forårsagende gener. Tilstedeværelsen af ​​differentiel methylering i sådanne regioner infererer funktionel relevans af disse epigenetiske ændringer i at kontrollere ekspressionen af ​​det eller de proksimale gener. Der er stærke cis-virkende genetiske effekter, der understøtter megen epigenetisk variation [7, 45], og i befolkningsbaserede undersøgelser er metoder, der bruger genetiske surrogater til at udlede en årsags- eller medierende rolle af epigenomforskelle, blevet anvendt [7, 46-48] . Brugen af ​​familiær genetisk information kan også føre til identifikation af potentielt kausative kandidatregioner, der viser fænotype-relateret differentiel methylering [49].

(ii) Timing af epigenetiske ændringer. Tilstedeværelsen af ​​et epigenetisk mærke før udvikling af en fænotype er et væsentligt træk ved kausalitet. Omvendt kan tilstedeværelsen af ​​et mærke i forbindelse med fedme, men ikke før dets udvikling, bruges til at udelukke kausalitet, men vil ikke udelukke en mulig rolle i efterfølgende fedme-relateret patologi.

iii) plausibel mekanisme. Dette refererer til epigenetiske ændringer, som er forbundet med ændret ekspression af gener med en etableret rolle i regulering af fænotypen af ​​interesse. Et sådant eksempel er foreningen af ​​methylering ved to CpG-steder ved CPT1A-genet med cirkulerende triglyceridniveauer [50]. CPT1A koder for carnitinpalmitoyltransferase 1A, et enzym med en central rolle i fedtsyremetabolismen, og dette er stærkt vejledende, at differentiel methylering af dette gen kan være årsagssammenhængende med ændringer i plasm triglyceridkoncentrationer.

Epigenom-bred associeringsstudier: Identifikation af epigenetiske biomarkører af metabolisk sundhed

En række nyere undersøgelser har fokuseret på at udforske sammenhænge mellem fedme/metaboliske sygdomme og DNA-methylering på tværs af genomet (tabel 2). Den hidtil største offentliggjorte EWAS, inklusive i alt 5465 individer, identificerede 37 methyleringssteder i blodet, der var forbundet med body mass index (BMI), inklusive steder i CPT1A, ABCG1 og SREBF1 [51]. En anden storstilet undersøgelse viste konsistente sammenhænge mellem BMI og methylering i HIF3A i fuldblod og fedtvæv [52], et fund som også delvist blev replikeret i andre undersøgelser [9, 51]. Andre nyligt rapporterede sammenhænge mellem fedme-relaterede mål og DNA-methylering omfatter (i) DNA-methyleringsforskelle mellem magert og overvægtige individer i LY86 i blodleukocytter [53]; (ii) associering mellem PGC1A-promotormetylering i fuldblod hos børn og fedme 5 år senere [54]; (iii) sammenhænge mellem forhold mellem talje og hofte og ADRB3-methylering i blod [55]; og (iv) sammenhænge mellem BMI, kropsfedtfordelingsmål og multiple DNA-methyleringssteder i fedtvæv [9, 56]. EWAS har også vist sammenhænge mellem DNA-methyleringssteder og blodlipider [55, 57], serummetabolitter [59], insulinresistens [60, 9] og T61DM [2, 48, 62] (tabel 63).

tabel 2 fortsUd fra disse undersøgelser er ændret methylering af PGC1A, HIF3A, ABCG1 og CPT1A og den tidligere beskrevne RXRA [18] fremkommet som biomarkører forbundet med eller måske forudsigende for metabolisk sundhed, som også er sandsynlige kandidater til en rolle i udviklingen af ​​metabolisk sygdom .

Interaktion mellem genotype og epigenomet

Genotype EpigenomeEpigenetisk variation er stærkt påvirket af den underliggende genetiske variation, med genotypen estimeret til at forklare ~20-40 % af variationen [6, 8]. For nylig er en række undersøgelser begyndt at integrere methylom- og genotypedata for at identificere methyleringskvantitative trait loci (meQTL) forbundet med sygdomsfænotyper. For eksempel er der i fedtvæv identificeret en meQTL, der overlapper med et BMI genetisk risikolocus i et forstærkerelement opstrøms for ADCY3 [8]. Andre undersøgelser har også identificeret overlapninger mellem kendt fedme og T2DM risiko loci og DMR'er forbundet med fedme og T2DM [43, 48, 62]. Methylering af en række af sådanne DMR'er blev også moduleret ved fodring med højt fedtindhold i mus [43] og vægttab hos mennesker [64]. Disse resultater identificerer en spændende sammenhæng mellem genetiske variationer forbundet med sygdomsmodtagelighed og deres sammenhæng med områder af genomet, der gennemgår epigenetiske modifikationer som reaktion på ernæringsmæssige udfordringer, hvilket indebærer en årsagssammenhæng. Den tætte forbindelse mellem genetisk og epigenetisk variation kan betyde deres væsentlige roller i at skabe individuel variation [65, 66]. Men mens disse resultater tyder på, at DNA-methylering kan være en mediator af genetiske effekter, er det også vigtigt at overveje, at både genetiske og epigenetiske processer kan virke uafhængigt på de samme gener. Tvillingundersøgelser [8, 63, 67] kan give vigtig indsigt og indikere, at inter-individuelle forskelle i niveauer af DNA-methylering hovedsageligt opstår fra ikke-delt miljø og stokastiske påvirkninger, minimalt fra fælles miljøpåvirkninger, men også med en betydelig påvirkning af genetiske variation.

Virkningen af ​​prænatal og postnatal miljø på epigenomet

fostermodelPrænatal miljø: To for nylig offentliggjorte undersøgelser anvendte menneskelige populationer, der oplevede naturlige variationer i næringsstofforsyning for at undersøge virkningen af ​​moderens ernæring før eller under graviditet på DNA-methylering hos afkomene [68, 69]. Den første undersøgelse anvendte en gambisk mor-barn-kohorte for at vise, at både sæsonvariationer i moderens methylendonindtag under graviditet og moderens BMI før graviditet var forbundet med ændret methylering hos spædbørnene [69]. Den anden undersøgelse udnyttede voksne afkom fra den hollandske Hunger Winter-kohorte til at undersøge effekten af ​​prænatal eksponering for en akut periode med alvorlig maternær underernæring på DNA-methylering af gener involveret i vækst og metabolisme i voksenalderen [68]. Resultaterne fremhævede vigtigheden af ​​tidspunktet for eksponeringen i dens indvirkning på epigenomet, da signifikante epigenetiske effekter kun blev identificeret hos personer, der blev udsat for hungersnød under tidlig drægtighed. Vigtigere er, at de epigenetiske ændringer fandt sted i forbindelse med øget BMI; det var imidlertid ikke muligt at fastslå i denne undersøgelse, om disse ændringer var til stede tidligere i livet eller en konsekvens af det højere BMI.

Andre nylige undersøgelser har givet beviser for, at prænatal overernæring og et overvægtigt eller diabetisk modermiljø også er forbundet med DNA-methyleringsændringer i gener relateret til embryonal udvikling, vækst og metabolisk sygdom hos afkomene [70 73].

Mens menneskelige data er knappe, er der tegn på, at fedral fedme kan føre til ændret methylering af prægede gener i den nyfødte [74], en effekt, der menes at være medieret via epigenetiske ændringer erhvervet under spermatogenese.

baby går i græsset og mudderetPostnatal miljø: Epigenomet etableres de novo under embryonal udvikling, og derfor har det prænatale miljø sandsynligvis den mest betydningsfulde indvirkning på epigenomet. Imidlertid er det nu klart, at der forekommer ændringer i det ældre epigenom under indflydelse af en række betingelser, herunder aldring, eksponering for toksiner og diætændringer. For eksempel er ændringer i DNA-methylering i adskillige gener i skeletmuskulatur og PGC1A i fedtvæv blevet påvist som reaktion på en fedtfattig diæt [75, 76]. Interventioner for at tabe kropsfedtmasse har også været forbundet med ændringer i DNA-methylering. Undersøgelser har rapporteret, at DNA-methyleringsprofiler af fedtvæv [43, 64], perifere mononukleære blodceller [77] og muskelvæv [78] hos tidligere overvægtige patienter ligner mere profiler hos magre forsøgspersoner efter vægttab. Vægttabskirurgi vendte også delvist ikke-alkoholiske fedtleversygdomsassocierede methyleringsændringer i leveren [79] og i en anden undersøgelse førte til hypomethylering af multiple fedme-kandidatgener med mere markante effekter i subkutan sammenlignet med omental (visceralt) fedt [64] . Akkumulerende beviser tyder på, at træningsinterventioner også kan påvirke DNA-methylering. De fleste af disse undersøgelser er blevet udført hos magre individer [80 82], men en øvelsesundersøgelse hos overvægtige T2DM-forsøgspersoner viste også ændringer i DNA-methylering, herunder i gener involveret i fedtsyre- og glukosetransport [83]. Epigenetiske ændringer forekommer også med aldring, og nylige data tyder på, at fedme spiller en forøgelse af dem [9, 84, 85]. Fedme fremskyndede den epigenetiske alder af levervæv, men i modsætning til resultaterne beskrevet ovenfor var denne effekt ikke reversibel efter vægttab [84].

Samlet set antyder beviser til støtte for evnen til at modulere epigenomet hos voksne, at der kan være mulighed for at gribe ind i postnatalt liv for at modulere eller reversere ugunstig epigenetisk programmering.

Effektstørrelser og forskelle mellem vævstyper

bindevævDNA methyleringsændringer forbundet med fedme eller induceret af kost eller livsstil interventioner og vægttab er generelt beskedne (<15%), selv om dette varierer afhængigt af fænotype og væv undersøges. For eksempel ændrer større end 20% er blevet rapporteret i fedtvæv efter vægttab [64] og foreninger mellem HIF3A methylering og BMI i fedtvæv blev mere udtalt end i blod [52].

Den biologiske relevans af relativt små methyleringsændringer er blevet sat spørgsmålstegn ved. I væv bestående af en blanding af celletyper kan en lille ændring i DNA-methylering imidlertid faktisk reflektere en signifikant ændring i en specifik cellefraktion. Integration af epigenomdata med transkriptom og andre epigenetiske data, såsom histon-modifikationer, er vigtig, da små DNA-methyleringsændringer kan afspejle større ændringer i chromatinstruktur og kunne associeres med bredere ændringer i genekspression. Den genomiske kontekst bør også overvejes; små ændringer inden for et regulatorisk element, såsom en promotor, forstærker eller isolator kan have funktionel betydning. I denne henseende er DMR for fedme samt regioner, der er påvirket af prænatal hungersnødseksponering og meQTL for metaboliske egenskaber, observeret overlappende forstærkningselementer [8, 43, 68]. Der er tegn på, at DNA-methylering i hungersnor-associerede områder faktisk kunne påvirke enhanceraktiviteten [68], der understøtter en rolle næringsinducerede methyleringsændringer i genregulering.

En væsentlig begrænsning i mange menneskelige undersøgelser er, at epigenetiske mærker ofte vurderes i perifert blod, snarere end i metabolisk relevante væv (fig. 2). Blodets heterogenitet er et problem, da forskellige cellepopulationer har forskellige epigenetiske signaturer, men der er udviklet algoritmer til at estimere den cellulære sammensætning for at overvinde dette problem [86]. Måske vigtigere er det, at epigenetiske mærker i blodceller ikke nødvendigvis rapporterer status for vævene af primær interesse. På trods af dette har nyere undersøgelser givet klare beviser for en sammenhæng mellem epigenetiske mærker i blodceller og BMI. I tilfælde af HIF3A, hvor niveauet af methylering (beta-værdi) i undersøgelsespopulationen varierede fra 0.14–0.52, var en stigning på 10 % i methylering forbundet med en BMI-stigning på 7.8 %�[52]. Ligeledes kan en 10 % forskel i PGC1A-methylering forudsige op til 12 % forskel i fedtmasse [54].

Fig 2konklusioner

Undersøgelsen af ​​epigenetiks rolle i fedme og stofskiftesygdomme er vokset hurtigt i de senere år, og der ophobes bevis for en sammenhæng mellem epigenetiske modifikationer og metaboliske sundhedsresultater hos mennesker. Potentielle epigenetiske biomarkører forbundet med fedme og metabolisk sundhed er også dukket op fra nyere undersøgelser. Valideringen af ​​epigenetiske mærker i flere kohorter, det faktum, at flere mærker findes i gener med en plausibel funktion i fedme og T2DM udvikling, samt overlapningen af ​​epigenetiske mærker med kendte fedme og T2DM genetiske loci styrker beviset for, at disse associationer er ægte. Kausalitet har hidtil været vanskelig at fastslå; men uanset om associationerne er kausale, kan de identificerede epigenetiske mærker stadig være relevante som biomarkører for fedme og risiko for stofskiftesygdomme.

Effektstørrelser i let tilgængelige væv såsom blod er små, men virker reproducerbare på trods af variation i etnicitet, vævstype og analysemetoder [51]. Også selv små DNA-methyleringsændringer kan have biologisk betydning. En integrerende omics tilgang vil være afgørende for yderligere at afsløre de komplekse interaktioner mellem epigenomet, transkriptomet, genomet og metaboliske sundhed. Langsgående undersøgelser, der helst spænder over flere generationer, er afgørende for at etablere årsagsforhold. Vi kan forvente flere sådanne undersøgelser i fremtiden, men det vil tage tid.

Mens dyreforsøg fortsat viser en virkning af det tidlige liv ernæringsmæssige eksponering for afkommets epigenom og metaboliske sundhed, menneskelige data er stadig begrænsede. Nylige undersøgelser har imidlertid givet klare beviser for, at eksponering for suboptimal ernæring i specifikke perioder med prænatal udvikling er forbundet med methyleringsændringer i afkommet og derfor har potentiale til at påvirke voksen fænotype. Dyreforsøg vil være vigtige for at verificere menneskelige fund i et mere kontrolleret miljø, hjælpe med at afgøre, om de identificerede methyleringsændringer har nogen indvirkning på metabolisk sundhed og optrævle de mekanismer, der ligger til grund for denne intergenerationelle/transgenerationelle epigenetiske regulering. Identifikationen af ​​kausale mekanismer, der ligger til grund for metaboliske hukommelsesreaktioner, måden, hvorpå de fænotypiske effekter overføres til successive generationer, graden af ​​påvirkning og stabilitet af det overførte træk og identifikation af en overordnet og samlende evolutionær kontekst er også stadig vigtige spørgsmål, der skal behandles. . Sidstnævnte er ofte indkapslet af den prædiktive adaptive responshypotese, dvs. et svar på et fremtidigt forventet miljø, der øger befolkningens kondition. Imidlertid er denne hypotese i stigende grad blevet sat spørgsmålstegn ved, da der er begrænset evidens for øget kondition senere i livet [87].

Sammenfattende er resultaterne lovende, da de epigenetiske ændringer er forbundet med voksen metabolisk sundhed, og de fungerer som mægler mellem ændret prænatal ernæring og efterfølgende øget risiko for dårlige metaboliske sundhedsresultater. Nye epigenetiske mærker er blevet identificeret, der er forbundet med foranstaltninger af metabolisk sundhed. Integration af forskellige lag af genomisk information har tilføjet yderligere støtte til årsagsforhold, og der har været yderligere undersøgelser, der viser virkninger af præ- og postnatale omgivelser på epigenomet og sundhed. Mens mange vigtige spørgsmål forbliver, har de seneste metodologiske fremskridt gjort det muligt for typer af omfattende befolkningsbaserede undersøgelser, der vil være nødvendige for at løse videnforskellene. Det næste årti lover at være en periode med stor aktivitet på dette vigtige forskningsområde.

Susan J. van Dijk1, Ross L. Tellam2, Janna L. Morrison3, Beverly S. Muhlhausler4,5 og Peter L. Molloy1 *

Konkurrerende interesser

Forfatterne erklærer, at de ikke har nogen konkurrerende interesser.

Forfatteres bidrag
Alle forfattere bidrog til udarbejdelse og kritisk revision af manuskriptet, og alle forfattere læste og godkendte det endelige manuskript.

Forfatteres information
Beverly S. Muhlhausler og Peter L. Molloy er fælles forrige forfattere.

Anerkendelser

Dette arbejde er blevet støttet af et tilskud fra Videnskabs- og Industrisubsidien (Grant RP03-064). JLM og BSM støttes af National Health and Medical Research Council Karriereudviklingsstipendier (JLM, APP1066916; BSM, APP1004211). Vi takker Lance Macaulay og Sue Mitchell for kritisk læsning og kommentarer til manuskriptet.

Forfatteroplysninger

1CSIRO Food and Nutrition Flagship, PO Box 52, North Ryde, NSW 1670, Australien. 2CSIRO Agriculture Flagship, 306 Carmody Road, St. Lucia, QLD 4067, Australien. 3Early Origins of Adult Health Research Group, School of Pharmacy and Medical Sciences, Sansom Institute for Health Research, University of South Australia, GPO Box 2471, Adelaide, SA 5001, Australia�4FOODplus Research Centre, Waite Campus, The University of Adelaide, PMB 1, Glen Osmond, SA 5064, Australien. 5Women's and Children's Health Research Institute, 72 King William Road, North Adelaide, SA 5006, Australien.

Blank
Referencer:

1. HVEM. HVEM | Overvægt og fedme. www.who.int/gho/ncd/
risk_factors/overweight/da/index.html. Tilgået 29. januar 2015.
2. Visscher PM, Brown MA, McCarthy MI, Yang J. Fem års GWAS-opdagelse.
Am J Hum Genet. 2012;90:7�24.
3. Locke AE, Kahali B, Berndt SI, Justice AE, Pers TH, Day FR, et al. Genetisk
undersøgelser af body mass index giver ny indsigt i fedmebiologi. Natur.
2015; 518: 197 206.
4. Ling C, Del Guerra S, Lupi R, R�nn T, Granhall C, Luthman H, et al.
Epigenetisk regulering af PPARGC1A i humane type 2 diabetiske øer og
effekt på insulinsekretion. Diabetologia. 2008;51:615�22.
5. Van Dijk SJ, Molloy PL, Varinli H, Morrison JL, Muhlhausler BS. Epigenetik
og menneskelig fedme. Int J Obes (Lond). 2015;39:85�97.
6. Teh AL, Pan H, Chen L, Ong ML, Dogra S, Wong J, et al. Effekten af
genotype og in utero miljø på interindividuel variation hos nyfødte
DNA-methylomer. Genome Res. 2014;24:1064�74.
7. Olsson AH, Volkov P, Bacos K, Dayeh T, Hall E, Nilsson EA, et al. Gennemgående
sammenhænge mellem genetisk og epigenetisk variation indflydelse
mRNA-ekspression og insulinsekretion i humane pancreas-øer. PLoS
Genet. 2014;10:e1004735.
8. Grundberg E, Meduri E, Sandling JK, Hedman AK, Keildson S, Buil A, et al.
Global analyse af DNA-methyleringsvariation i fedtvæv fra tvillinger
afslører links til sygdomsassocierede varianter i distale regulatoriske elementer.
Am J Hum Genet. 2013;93:876�90.
9. Ronn T, Volkov P, Gillberg L, Kokosar M, Perfilyev A, Jacobsen AL, et al.
Indvirkning af alder, BMI og HbA1c-niveauer på det genom-brede DNA
methylerings- og mRNA-ekspressionsmønstre i humant fedtvæv
og identifikation af epigenetiske biomarkører i blod. Hum Mol Genet.
2015; 24: 3792 813.
10. Waterland RA, Michels KB. Epigenetisk udviklingsepidemiologi
oprindelseshypotese. Annu Rev Nutr. 2007;27:363�88.
11. McMillen IC, Rattanatray L, Duffield JA, Morrison JL, MacLaughlin SM, Gentili
S, et al. Den tidlige oprindelse af senere fedme: veje og mekanismer. Adv
Exp Med Biol. 2009;646:71�81.
12. Ravelli A, van der Meulen J, Michels R, Osmond C, Barker D, Hales C, et al.
Glucosetolerance hos voksne efter prænatal eksponering for hungersnød. Lancet.
1998; 351: 173 7.
13. McMillen IC, MacLaughlin SM, Muhlhausler BS, Gentili S, Duffield JL,
Morrison JL. Udviklingsmæssige oprindelse af voksen sundhed og sygdom: rollen som
perikonceptionel og føtal ernæring. Basic Clin Pharmacol Toxicol.
2008; 102: 82 9.
14. Zhang S, Rattanatray L, McMillen IC, Suter CM, Morrison JL. Periconceptionel
ernæring og tidlig programmering af et liv med fedme eller modgang. Prog
Biophys Mol Biol. 2011;106:307�14.
15. Bouret S, Levin BE, Ozanne SE. Gen-miljø interaktioner kontrollerende
energi- og glukosehomeostase og udviklingen af ​​fedme.
Physiol Rev. 2015;95:47�82.
16. Borengasser SJ, Zhong Y, Kang P, Lindsey F, Ronis MJ, Badger TM, et al.
Maternel fedme øger hvidt fedtvævsdifferentiering og ændrer
DNA-methylering i genomskala hos hanrotteafkom. Endokrinologi.
2013; 154: 4113 25.
17. Gluckman PD, Lillycrop KA, Vickers MH, Pleasants AB, Phillips ES, Beedle AS,
et al. Metabolisk plasticitet under pattedyrs udvikling er retningsbestemt
afhængig af den tidlige ernæringstilstand. Proc Natl Acad Sci US A.
2007; 104: 12796 800.
18. Godfrey KM, Sheppard A, Gluckman PD, Lillycrop KA, Burdge GC, McLean C,
et al. Epigenetisk genpromotor-methylering ved fødslen er forbundet med
barnets senere overvægt. Diabetes. 2011;60:1528�34.
19. McMillen IC, Adam CL, Muhlhausler BS. Tidlig oprindelse af fedme:
programmering af appetitreguleringssystemet. J Physiol. 2005;565(Pt 1):9�17.
20. Begum G, Stevens A, Smith EB, Connor K, Challis JR, Bloomfield F, et al.
Epigenetiske ændringer i føtale hypothalamus energiregulerende veje er
forbundet med moderens underernæring og twinning. FASEB J.
2012; 26: 1694 703.
21. Ge ZJ, Liang QX, Hou Y, Han ZM, Schatten H, Sun QY, et al. Moderlig fedme
og diabetes kan forårsage DNA-methyleringsændring i spermatozoer af
afkom hos mus. Reprod Biol Endocrinol. 2014;12:29.
22. Jousse C, Parry L, Lambert-Langlais S, Maurin AC, Averous J, Bruhat A, et al.
Perinatal underernæring påvirker methyleringen og ekspressionen af ​​leptinet
gen hos voksne: implikation for forståelsen af ​​metabolisk syndrom.
FASEB J. 2011;25:3271�8.
23. Lan X, Cretney EC, Kropp J, Khateeb K, Berg MA, Penagaricano F, et al.
Moderens kost under graviditeten inducerer genekspression og DNA
methyleringsændringer i fostervæv hos får. Front Genet. 2013;4:49.
24. Li CC, Young PE, Maloney CA, Eaton SA, Cowley MJ, Buckland ME, et al.
Maternel fedme og diabetes inducerer latente metaboliske defekter og
udbredte epigenetiske ændringer i isogene mus. Epigenetik. 2013;8:602�11.
25. Lillycrop KA, Phillips ES, Jackson AA, Hanson MA, Burdge GC. Kostprotein
begrænsning af drægtige rotter inducerer og folinsyretilskud forhindrer
epigenetisk modifikation af hepatisk genekspression i afkommet. J Nutr.
2005; 135: 1382 6.
26. Radford EJ, Ito M, Shi H, Corish JA, Yamazawa K, Isganaitis E, et al. I utero
effekter. In utero underernæring forstyrrer den voksne sperm methylom
og intergenerationel metabolisme. Videnskab. 2014;345(80):1255903.
27. Suter M, Bocock P, Showalter L, Hu M, Shope C, McKnight R, et al.
Epigenomics: moderens fedtholdige diæteksponering i utero forstyrrer
perifer cirkadisk genekspression hos ikke-menneskelige primater. FASEB J.
2011; 25: 714 26.
28. Suter MA, Ma J, Vuguin PM, Hartil K, Fiallo A, Harris RA, et al. I utero
udsættelse for en maternell kost med højt fedtindhold ændrer den epigenetiske histonkode i en
murin model. Am J Obs Gynecol. 2014;210:463 e1�463 e11.
29. Tosh DN, Fu Q, Callaway CW, McKnight RA, McMillen IC, Ross MG, et al.
Epigenetik af programmeret fedme: ændring i IUGR rottehepatisk IGF1
mRNA-ekspression og histonstruktur i hurtig vs. forsinket postnatal
indhentningsvækst. Am J Physiol Gastrointest Lever Physiol.
2010;299:G1023�9.
30. Sandovici I, Smith NH, Nitert MD, Ackers-Johnson M, Uribe-Lewis S, Ito Y,
et al. Moderens kost og aldring ændrer den epigenetiske kontrol af en promotor
interaktion ved Hnf4a-genet i pancreas-øer hos rotter. Proc Natl
Acad Sci US A. 2011;108:5449�54.
31. Braunschweig M, Jagannathan V, Gutzwiller A, Bee G. Undersøgelser vedr.
transgenerationel epigenetisk respons ned ad hanlinjen hos F2-grise. PLoS
En. 2012;7, e30583.
32. Carone BR, Fauquier L, Habib N, Shea JM, Hart CE, Li R, et al. Faderligt
induceret transgenerationel miljøomprogrammering af metabolisk
genekspression hos pattedyr. Celle. 2010;143:1084�96.
33. Ost A, Lempradl A, Casas E, Weigert M, Tiko T, Deniz M, et al. Faderlig kost
definerer afkoms kromatintilstand og intergenerationel fedme. Celle.
2014; 159: 1352 64.
34. Mart�nez D, Pentinat T, Rib� S, Daviaud C, Bloks VW, Cebri� J, et al. I utero
underernæring hos hanmus programmerer leverlipidmetabolisme i anden generation
afkom, der involverer ændret Lxra DNA-methylering. Celle Metab.
2014; 19: 941 51.
35. Wei Y, Yang CR, Wei YP, Zhao ZA, Hou Y, Schatten H, et al. Faderligt
induceret transgenerationel arv af modtagelighed for diabetes i
pattedyr. Proc Natl Acad Sci US A. 2014;111:1873�8.
36. Grossniklaus U, Kelly WG, Kelly B, Ferguson-Smith AC, Pembrey M, Lindquist
S. Transgenerationel epigenetisk arv: hvor vigtig er den? Nat Rev
Genet. 2013;14:228�35.
37. Pembrey M, Saffery R, ​​Bygren LO. Menneskelige transgenerationelle reaktioner på
erfaring i tidligt liv: potentiel indvirkning på udvikling, sundhed og
biomedicinsk forskning. J Med Genet. 2014;51:563�72.
38. Wolff GL, Kodell RL, Moore SR, Cooney CA. Maternal epigenetik og methyl
kosttilskud påvirker agouti-genekspression i Avy/a-mus. FASEB J.
1998; 12: 949 57.
39. Jirtle RL, Skinner MK. Miljøepigenomi og sygdomsmodtagelighed.
Nat Rev Genet. 2007;8:253�62.
40. Morgan HD, Sutherland HG, Martin DI, Whitelaw E. Epigenetisk arv kl.
agouti-locuset i musen. Nat Genet. 1999;23:314�8.
41. Cropley JE, Suter CM, Beckman KB, Martin DI. Kimlinje epigenetisk
modifikation af den murine A vy allel ved ernæringstilskud. Proc
Natl Acad Sci US A. 2006;103:17308�12.
42. Hoile SP, Lillycrop KA, Thomas NA, Hanson MA, Burdge GC. Kostprotein
begrænsning under F0-drægtighed hos rotter inducerer transgenerationelle ændringer i
det hepatiske transkriptom hos kvindelige afkom. PLoS One. 2011;6, e21668.
43. Multhaup ML, Seldin MM, Jaffe AE, Lei X, Kirchner H, Mondal P, et al. Musemenneske
eksperimentel epigenetisk analyse afslører kostmål og
genetisk ansvar for diabetiske fænotyper. Celle Metab. 2015;21:138�49.
44. Michels KB, Binder AM, Dedeurwaerder S, Epstein CB, Greally JM, Gut I, et al.
Anbefalinger til design og analyse af epigenom-dækkende
foreningsstudier. Nat Metoder. 2013;10:949�55.
45. Dayeh TA, Olsson AH, Volkov P, Almgren P, R�nn T, Ling C. Identifikation af
CpG-SNP'er forbundet med type 2-diabetes og differentiel DNA-methylering
i menneskelige pancreas-øer. Diabetologia. 2013;56:1036�46.
46. ​​Relton CL, Davey Smith G. To-trins epigenetisk Mendelsk randomisering: en
strategi til at fastslå den kausale rolle af epigenetiske processer i pathways
til sygdom. Int J Epidemiol. 2012;41:161�76.
47. Liu Y, Aryee MJ, Padyukov L, Fallin MD, Hesselberg E, Runarsson A, et al.
Epigenom-dækkende associationsdata implicerer DNA-methylering som en
formidler af genetisk risiko ved reumatoid arthritis. Nat Biotechnol.
2013; 31: 142 7.
48. Yuan W, Xia Y, Bell CG, Yet I, Ferreira T, Ward KJ, et al. En integreret
epigenomisk analyse for type 2 diabetes modtagelighed loci hos monozygotiske
tvillinger. Nat Commun. 2014;5:5719.
49. Nitert MD, Dayeh T, Volkov P, Elgzyri T, Hall E, Nilsson E, et al. Virkningen af ​​en
træningsintervention på DNA-methylering i skeletmuskulatur fra første grad
pårørende til patienter med type 2-diabetes. Diabetes. 2012;61:3322�32.
50. Gagnon F, Assi D, Carri A, Morange PE, Trgou�t DA. Robust validering af
methyleringsniveauer association på CPT1A locus med lipid plasma niveauer.
J Lipid Res. 2014;55:1189�91.
51. Demerath EW, Guan W, Grove ML, Aslibekyan S, Mendelson M, Zhou YH,
et al. Epigenom-wide association atudy (EWAS) af BMI, BMI-ændring og
taljeomkreds hos afroamerikanske voksne identificerer flere replikerede
loci. Hum Mol Genet. 2015:ddv161�.
52. Dick KJ, Nelson CP, Tsaprouni L, Sandling JK, Assi D, Wahl S, et al. DNA
methylering og kropsmasseindeks: en genom-dækkende analyse. Lancet.
2014; 6736: 1 9.
53. Su S, Zhu H, Xu X, Wang X, Dong Y, Kapuku G, et al. DNA-methylering af
LY86-genet er forbundet med fedme, insulinresistens og
betændelse. Twin Res Hum Genet. 2014;17:183�91.
54. Clarke-Harris R, Wilkin TJ, Hosking J, Pinkney J, Jeffery AN, Metcalf BS, et al.
PGC1? promotormethylering i blod ved 5�7 år forudsiger fedme fra
9 til 14 år (EarlyBird 50). Diabetes. 2014;63:2528�37.
55. Guay SP, Brisson D, Lamarche B, Biron S, Lescelleur O, Biertho L, et al.
ADRB3-genpromotor DNA-methylering i blod og visceralt fedt
væv er forbundet med metaboliske forstyrrelser hos mænd. Epigenomi.
2014; 6: 33 43.
56. Agha G, Houseman EA, Kelsey KT, Eaton CB, Buka SL, Loucks EB. Fedme er
forbundet med DNA-methyleringsprofil i fedtvæv. Int J Epidemiol.
2014: 1 11.
57. Irvin MR, Zhi D, Joehanes R, Mendelson M, Aslibekyan S, Claas SA, et al.
Epigenomdækkende associationsundersøgelse af fastende blodlipider i genetik af
lipidsænkende medicin og kostnetværksundersøgelse. Cirkulation. 2014;130:565�72.
58. Frazier-Wood AC, Aslibekyan S, Absher DM, Hopkins PN, Sha J, Tsai MY, et al.
Methylering ved CPT1A locus er forbundet med lipoprotein subfraktion
profiler. J Lipid Res. 2014;55:1324�30.
59. Pfeifferm L, Wahl S, Pilling LC, Reischl E, Sandling JK, Kunze S, et al. DNA
methylering af lipid-relaterede gener påvirker blodlipidniveauer. Circ Cardiovasc
Genet. 2015.
60. Petersen AK, Zeilinger S, Kastenmüller G, R�misch-Margl W, Brugger M, Peters
A, et al. Epigenetik møder metabolomics: en epigenom-dækkende sammenhæng
undersøgelse med blodserum metaboliske træk. Hum Mol Genet. 2014;23:534�45.
61. Hidalgo B, Irvin MR, Sha J, Zhi D, Aslibekyan S, Absher D, et al. Epigenomfattende
associationsundersøgelse af fastemål for glukose, insulin og HOMA-IR
i genetik af lipidsænkende lægemidler og kostnetværksundersøgelse. Diabetes.
2014; 63: 801 7.
62. Dayeh T, Volkov P, Sal� S, Hall E, Nilsson E, Olsson AH, et al. Genom-dækkende
DNA-methyleringsanalyse af humane pancreas-øer fra type 2-diabetikere
og ikke-diabetiske donorer identificerer kandidatgener, der påvirker insulin
sekretion. PLoS Genet. 2014;10, e1004160.
63. Nilsson E, Jansson PA, Perfilyev A, Volkov P, Pedersen M, Svensson MK, et al.
Ændret DNA-methylering og differentiel ekspression af gener, der påvirker
stofskifte og betændelse i fedtvæv fra forsøgspersoner med type 2
diabetes. Diabetes. 2014;63:2962�76.
64. Benton MC, Johnstone A, Eccles D, Harmon B, Hayes MT, Lea RA, et al. En analyse af DNA-methylering i humant fedtvæv afslører differentiel modifikation af fedmegener før og efter gastrisk bypass og vægt
tab. Gene. 2015;16:1�21.
65. Bateson P, Gluckman P. Plasticitet og robusthed i udvikling og
udvikling. Int J Epidemiol. 2012;41:219�23.
66. Feinberg AP, Irizarry RA, Feinberg AP, Irizarry RA. Evolution i sundhed og
medicin Sackler kollokvium: stokastisk epigenetisk variation som en kørsel
udviklingskraft, evolutionær tilpasning og sygdom. Proc Natl Acad
Sci US A. 2010;107(Suppl):1757�64.
67. Martino D, Loke YJ, Gordon L, Ollikainen M, Cruickshank MN, Saffery R, ​​et al.
Longitudinel, genom-skala analyse af DNA-methylering i tvillinger fra fødslen
til 18 måneders alderen afslører hurtig epigenetisk ændring i det tidlige liv og parspecifikke
virkninger af uoverensstemmelse. Genom Biol. 2013;14:R42.
68. Tobi EW, Goeman JJ, Monajemi R, Gu H, Putter H, Zhang Y, et al. DNA
methyleringssignaturer forbinder prænatal hungersnød eksponering til vækst og
stofskifte. Nat Commun. 2014;5:5592.
69. Dominguez-Salas P, Moore SE, Baker MS, Bergen AW, Cox SE, Dyer RA, et al.
Moderens ernæring ved undfangelsen modulerer DNA-methylering af mennesker
metastabile epialleller. Nat Commun. 2014;5:3746.
70. Quilter CR, Cooper WN, Cliffe KM, Skinner BM, Prentice PM, Nelson L, et al.
Indvirkning på afkoms methyleringsmønstre af maternel svangerskabsdiabetes
mellitus og intrauterin væksthæmning tyder på almindelige gener og
veje forbundet med efterfølgende type 2-diabetesrisiko. FASEB J. 2014:1�12.
71. Morales E, Groom A, Lawlor DA, Relton CL. DNA-methyleringssignaturer i
navlestrengsblod forbundet med moderens svangerskabsforøgelse: resultater fra
ALSPAC-kohorten. BMC Res Notes. 2014;7:278.
72. Ruchat SM, Houde AA, Voisin G, St-Pierre J, Perron P, Baillargeon JP, et al.
Svangerskabsdiabetes mellitus påvirker epigenetisk overvejende gener
involveret i stofskiftesygdomme. Epigenetik. 2013;8:935�43.
73. Liu X, Chen Q, Tsai HJ, Wang G, Hong X, Zhou Y, et al. Moderlig
førforståelse body mass index og afkoms navlestrengsblod DNA
methylering: udforskning af sygdommens tidlige liv. Environ Mol
Mutagen. 2014;55:223�30.
74. Soubry A, Murphy SK, Wang F, Huang Z, Vidal AC, Fuemmeler BF, et al.
Nyfødte af overvægtige forældre har ændrede DNA-methyleringsmønstre kl
indprentede gener. Int J Obes (Lond). 2015;39:650�7.
75. Jacobsen SC, Br�ns C, Bork-Jensen J, Ribel-Madsen R, Yang B, Lara E, et al.
Effekter af kortvarig overfodring med højt fedtindhold på DNA i hele genomet
methylering i skeletmuskulaturen hos raske unge mænd. Diabetologia.
2012; 55: 3341 9.
76. Gillberg L, Jacobsen SC, R�nn T, Br�ns C, Vaag A. PPARGC1A DNA
methylering i subkutant fedtvæv hos personer med lav fødselsvægt�
virkningen af ​​5 dages overfodring med højt fedtindhold. Metabolisme. 2014;63:263�71.
77. Huang YT, Maccani JZJ, Hawley NL, Wing RR, Kelsey KT, McCaffery JM.
Epigenetiske mønstre hos vellykkede vægttabsvedligeholdere: en pilotundersøgelse. Int J
Obes (Lond). 2015;39:865�8.
78. Barres R, Kirchner H, Rasmussen M, Yan J, Kantor FR, Krook A, N�slund E,
Zierath JR. Vægttab efter gastrisk bypass-operation ved menneskelig fedme
omformer promotor-methylering. Cell Rep. 2013:1�8.
79. Ahrens M, Ammerpohl O, von Sch�nfels W, Kolarova J, Bens S, Itzel T, et al.
DNA-methyleringsanalyse ved ikke-alkoholisk fedtleversygdom tyder på
distinkte sygdomsspecifikke og remodeling signaturer efter fedmekirurgi.
Celle Metab. 2013;18:296�302.
80. Voisin S, Eynon N, Yan X, biskop DJ. Motionstræning og DNA-methylering
hos mennesker. Acta Physiol (Oxf). 2014;213:39�59.
81. Lindholm ME, Marabita F, Gomez-Cabrero D, Rundqvist H, Ekstr�m TJ,
Tegnér J, et al. En integrativ analyse afslører koordineret omprogrammering
af epigenomet og transkriptomet i human skeletmuskulatur efter
uddannelse. Epigenetik. 2014;9:1557�69.
82. Denham J, O�Brien BJ, Marques FZ, Charchar FJ. Ændringer i leukocytten
methylom og dets effekt på kardiovaskulære gener efter træning.
J Appl Physiol. 2014:jap.00878.2014.
83. Rowlands DS, Page RA, Sukala WR, Giri M, Ghimbovschi SD, Hayat I, et al.
Multi-omiske integrerede netværk forbinder DNA-methylering og miRNA med
skeletmuskelplasticitet til kronisk træning ved type 2 diabetisk fedme.
Fysiol Genomics. 2014;46:747�65.
84. Horvath S, Erhart W, Brosch M, Ammerpohl O, von Schonfels W, Ahrens M,
et al. Fedme fremskynder epigenetisk aldring af menneskelig lever. Proc Natl Acad
Sci. 2014;111:15538�43.
85. Alm�n MS, Nilsson EK, Jacobsson JA, Kalnina I, Klovins J, Fredriksson R, et al.
Genom-dækkende analyse afslører DNA-methyleringsmarkører, der varierer med
både alder og overvægt. Gene. 2014.;548:61�7
86. Houseman EA, Molitor J, Marsit CJ. Referencefri celleblandingsjusteringer
i analyse af DNA-methyleringsdata. Bioinformatik. 2014;30:1431�9.
87. Wells JC. En kritisk vurdering af hypotesen om prædiktiv adaptiv respons.
Int J Epidemiol. 2012;41:229�35.
88. Williams-Wyss O, Zhang S, MacLaughlin SM, Kleemann D, Walker SK, Suter
CM, et al. Embryonal og perikonceptionel underernæring i
får har forskellige virkninger på binyrens epigenotype, vækst og
udvikling. Am J Physiol Endocrinol Metab. 2014;307:E141�50.
89. Zhang S, Rattanatray L, Morrison JL, Nicholas LM, Lie S, McMillen IC.
Moderlig fedme og den tidlige oprindelse af fedme blandt børn: opvejning
fordelene og omkostningerne ved moderens vægttab i den perikonceptionelle
periode for afkommet. Exp Diabetes Res. 2011;2011:585749.
90. Zhang S, Williams-Wyss O, MacLaughlin SM, Walker SK, Kleemann DO, Suter
CM, et al. Moderens underernæring i den første uge efter undfangelsen
resulterer i nedsat ekspression af glukokortikoid receptor mRNA i
fravær af GR exon 17-hypermethylering i fosterets hypofyse på det seneste
drægtighed. J Dev Orig Heal Dis. 2013;4:391�401.
91. Lie S, Morrison JL, Williams-Wyss O, Suter CM, Humphreys DT, Ozanne SE,
et al. Periconceptionel underernæring programmerer ændringer i insulinsignalering
molekyler og mikroRNA'er i skeletmuskulatur i singleton- og tvillingefoster
får. Biol Reprod. 2014;90:5.
92. Van Straten EM, van Meer H, Huijkman NC, van Dijk TH, Baller JF, Verkade
HJ, et al. Føtal lever X-receptoraktivering inducerer akut lipogenese men
påvirker ikke plasmalipidrespons på en fedtrig diæt hos voksne mus. Am J
Physiol Endocrinol Metab. 2009;297:E1171�8.
93. Fernandez-Twinn DS, Alfaradhi MZ, Martin-Gronert MS, Duque-Guimaraes
DE, Piekarz A, Ferland-McCollough D, et al. Nedregulering af IRS-1 in
fedtvæv fra afkom af overvægtige mus programmeres cellautonomt
gennem post-transkriptionelle mekanismer. Mol Metab.
2014; 3: 325 33.
94. Waterland RA, Travisano M, Tahiliani KG. Kostinduceret hypermethylering kl
agouti levedygtig gul nedarves ikke transgenerationelt gennem hunnen.
FASEB J. 2007;21:3380�5.
95. Ge ZJ, Luo SM, Lin F, Liang QX, Huang L, Wei YC, et al. DNA-methylering i
oocytter og lever fra hunmus og deres afkom: virkninger af diætinduceret med højt fedtindhold
fedme. Env Heal Perspect. 2014;122:159�64.
96. Ollikainen M, Ismail K, Gervin K, Kyll�nen A, Hakkarainen A, Lundbom J, et al.
Genomomfattende blod-DNA-methyleringsændringer ved regulatoriske elementer
og heterokromatiske områder hos enæggede tvillinger, der er uenige for fedme
og leverfedt. Clin Epigenetics. 2015; 7: 1 13.

Luk harmonika